Particularitatile morfologice si topografice ale apa­ratelor si organelor hamsterului auriu sirian au constituit obiect de studiu pentru numerosi cercetatori.

Capul hamsterului este de forma conica, aproape obtuza. Caracteristica la hamster este cavitatea infra­orbitara a carei apofiza supraorbitara tinde sa fuzioneze in fata cu cutia craniana. Ochii sunt negri stralucitori, urechile milci si rotunde, mai inchise la culoare. Mustatile constituie un amestec de fire albe si negre. Gura prezinta o dantura formata din 4 inci­sivi si 12 molari (acestia avand rol secundar in masticatie), fara canini. Molarii sunt infipti cate 3 pe fiecare, maxilar, dimensiunile lor descrescand dinainte spre inapoi. Intre incisivi si molari se inscrie un spatiu liber denumit diastema. In diastema se deschid pungile jugale (cate una de fiecare parte a obrajilor), diverticule ale peretilor bucali. Pungile dispun de o musculatura longitudinala reprezentata de extensia muchiului buccinator. Rolul acestui muschi este de a contracta si a goli punga prin orificiul exterior care se deschide in diastema. Este descris si un muschi retructor, care opreste o eventuala golire a pungii. Pungile constituie adevarate rezervoare de depozitare provizorie a hranei (uneori si a puilor nou-nascuti), Cand sunt pline cu alimente, pungile se destind, ajungand la dimensiunui de 3-4 cm lungime si 2 cm latime.

Gatul hamsterului este relativ scurt, avand pielea cutata deasupra, ceea ce faciliteaza prinderea si fixarea animalului. Blanita gatului esre brazdata de un guler alb-roscat. In aceasta zona sunt amplasate glandele: parotida, sublinguala, major, submandibulara.

Corpul hamsterului, lung si acoperit de o blana matasoasa si supla este ceva mai mare la femela decat la mascul. Perii care formeaza blana sunt de culoare aurie-roscata pe cap, spate, lombe si crupa, iar pe abdomen prezinta o nuanta mai deschisa, alb-gri. Inaintea membrelor anterioare se incing doua dungi alb-roscate care urca pana la jumatatea gatului.

Cele doua sexe se recunosc prin organele genitale: masculul prin testicule care formeaza o punga bilo­bata triunghiulara al carei varf atinge coada anima­lului, furoul si anusul fiind pigmentate si separate de un perineu lung de 7-8 mm; la femela distanta dintre vulva nepigmentata si anusul pigmen­tat este mai mica. Abdomenul prezinta doua randuri de mamele (al caror numar este de 8-10 sau mai mult), mult mai evidente in perioda gestatiei si alaptarii.

Picioarele sunt scurte si se termina cu 5 degete, care se prelungesc cu gheare. Degetul mare de la piciorul anterior este rudimentar. Culoarea pielii de pe talpi este roz-carnat. Membrele posterioare dispun de o musculatura dezvoltata, ceea ce permite hamsterului sa faca salturi in caz de nevoie. Coada animalului este scurta, groasa si acoperita de peri albi.